بخشی از متن مقاله همسانه¬سازي مولکولي, جداسازي و توصيف يک ژن پکتات لياز از بافت حبه انگور بي¬دانه سفيد (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid) :
تعداد صفحات :21
یکی از فعالیتهای مهم سلولهای گیاهی در دوره رشد آن, فعال نمودن ژنهای عامل و آنزیمهای موثر در تجزیه برخی مواد ذخیره شده در مراحل اولیه تشکیل میوه است. بر اساس مطالعات انجام شده, آنزیمهای مختلفی در تخریب دیواره سلولی و نرم شدن بافت میوه نقش دارند. از مهمترین این آنزیمها, آنزیم پکتات لیاز میباشد. در این مطالعه, cDNA ناقص یکی از ژنهای پکتات لیاز از بافت حبه انگور بیدانه سفید (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز نسخهبرداری معکوس (Reverse Transcriptase-PCR) جداسازی و در ناقل pUC19 همسانهسازی و ساختار مولکولی, ویژگیهای بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی این ژن, تحت عنوان VvPel1, بهطول bp429 بوده و یک پروتئین با 143 اسیدآمینه را رمز میکند. وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه ایزوالکتریک پیشبینی شده این پروتئین بهترتیب برابر 78/15 کیلو دالتون و 53/6 میباشد. بررسی ساختارهای دوم و سوم توالی پروتئینی VvPel1 نشان داد که این پروتئین از نظر ساختاری مشابه با توالیهای پکتات لیاز گزارش شده از موجودات دیگر میباشد. توالی پروتئینی بهدست آمده شباهت زیادی را با توالیهای پکتات لیاز سایر گیاهان از قبیل Ricinus communis, Fragaria ananassa, Prunus persica و Populus trichocarpa نشان داد. بررسی فیلوژنتیکی نیز مشخص کرد که این ژن به زیرگروه I پکتات لیازهای گیاهی تعلق دارد.