بخشی از متن مقاله خوشه‌بندي ژنتيکي گونه غالب باکتري‌هاي گره‌زاي ريشه باقلا بر پايه ژن 16 rDNA و الگوي فنوتيپ آن‌ها :
تعداد صفحات :12
باقلا یکی از مهمترین بقولات دانهای جهان است. شناسایی و خوشهبندی باکتریهای همزیست با ریشه این گیاه برای استفاده زراعی و نیز تعیین جایگاه ردهبندی باکتری از اهمیت ویژهای برخوردار است. در بهار 1388 از ریشه باقلا در مزارع استان لرستان با حرکت زیگزاگی در قطر مزرعه بهصورت تصادفی نمونهبرداری شد. از گرههای ریشه باقلا 65 استرین باکتری روی محیطکشت YMA جدا شد که 58 استرین گرهزا بودند. ویژگیهای فنوتیپی استرینهای گرهزا براساس روشهای استاندارد باکتریشناسی بررسی شد. نتایج نشان داد که باکتریهای گرهزای ریشه باقلا در استان لرستان وابسته به گونههایRhizobium leguminosarum بهعنوان گونه غالب وR. etli هستند. پس از استخراج DNA از استرینها از پرایمرهای اختصاصی برای تکثیر ژن کدکننده 16SrDNA استفاده شد. توالی محصول PCR بهدست آمده از یک استرین نماینده غالب تعیین و با بانک دادههای سایت NCBI مقایسه شد. نتایج حاصل از مقایسه توالی نوکلئوتیدهای تکثیر شده ژن مزبور نشان داد که استرین NSZ3 شباهت بالایی به استرینR. leguminosarum bv. viciae strain BIHB 1157 دارد. خوشهبندی استرینهای جدا شده بیانگر قرار گرفتن استرین NSZ3در یک خوشه جداگانه ولی با شباهت بالا و درمیان استرینهای متنوع شناسایی شده R. leguminosarum bv. viciae بود.